Protein–RNA interactions for Protein: P70407

Cdh9, Cadherin-9, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh9P70407 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh9P70407 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh9P70407 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh9P70407 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.7 ms