Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tubb4bP68372 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubb4bP68372 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tubb4bP68372 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms