Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pfn1P62962 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pfn1P62962 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfn1P62962 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms