Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tdrd6P61407 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tdrd6P61407 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tdrd6P61407 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tdrd6P61407 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Tdrd6P61407 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tdrd6P61407 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms