Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Smg6P61406 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Smg6P61406 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smg6P61406 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smg6P61406 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Smg6P61406 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Smg6P61406 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smg6P61406 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smg6P61406 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Smg6P61406 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smg6P61406 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smg6P61406 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smg6P61406 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms