Protein–RNA interactions for Protein: P61219

Polr2f, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2fP61219 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Polr2fP61219 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Polr2fP61219 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Polr2fP61219 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms