Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CgnP59242 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CgnP59242 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CgnP59242 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CgnP59242 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CgnP59242 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CgnP59242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CgnP59242 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CgnP59242 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CgnP59242 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CgnP59242 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CgnP59242 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CgnP59242 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CgnP59242 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CgnP59242 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CgnP59242 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CgnP59242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CgnP59242 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CgnP59242 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CgnP59242 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CgnP59242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CgnP59242 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CgnP59242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CgnP59242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CgnP59242 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CgnP59242 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CgnP59242 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CgnP59242 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CgnP59242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CgnP59242 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CgnP59242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CgnP59242 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CgnP59242 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CgnP59242 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CgnP59242 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CgnP59242 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CgnP59242 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CgnP59242 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CgnP59242 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CgnP59242 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CgnP59242 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CgnP59242 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CgnP59242 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CgnP59242 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CgnP59242 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CgnP59242 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CgnP59242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CgnP59242 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CgnP59242 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CgnP59242 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CgnP59242 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CgnP59242 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CgnP59242 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CgnP59242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CgnP59242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CgnP59242 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CgnP59242 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CgnP59242 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CgnP59242 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CgnP59242 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.8 ms