Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Nphp4P59240 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nphp4P59240 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Nphp4P59240 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.2 ms