Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Pcif1P59114 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcif1P59114 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms