Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Usp25P57080 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp25P57080 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Usp25P57080 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Usp25P57080 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp25P57080 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp25P57080 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms