Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Defa11P50709 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Defa11P50709 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Defa11P50709 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Defa11P50709 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa11P50709 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Defa11P50709 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms