Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tmod1P49813 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tmod1P49813 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tmod1P49813 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms