Protein–RNA interactions for Protein: P42703

Lifr, Leukemia inhibitory factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,092 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LifrP42703 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LifrP42703 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LifrP42703 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LifrP42703 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LifrP42703 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LifrP42703 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LifrP42703 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LifrP42703 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LifrP42703 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LifrP42703 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LifrP42703 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LifrP42703 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LifrP42703 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LifrP42703 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LifrP42703 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LifrP42703 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LifrP42703 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LifrP42703 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LifrP42703 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LifrP42703 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LifrP42703 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LifrP42703 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LifrP42703 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LifrP42703 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LifrP42703 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LifrP42703 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LifrP42703 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LifrP42703 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LifrP42703 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LifrP42703 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LifrP42703 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LifrP42703 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LifrP42703 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LifrP42703 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LifrP42703 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LifrP42703 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LifrP42703 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LifrP42703 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LifrP42703 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LifrP42703 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LifrP42703 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LifrP42703 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LifrP42703 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LifrP42703 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LifrP42703 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LifrP42703 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LifrP42703 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LifrP42703 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LifrP42703 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LifrP42703 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LifrP42703 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LifrP42703 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LifrP42703 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LifrP42703 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LifrP42703 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LifrP42703 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LifrP42703 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LifrP42703 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LifrP42703 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LifrP42703 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LifrP42703 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LifrP42703 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LifrP42703 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LifrP42703 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LifrP42703 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms