Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nkx2-5P42582 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nkx2-5P42582 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nkx2-5P42582 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nkx2-5P42582 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms