Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TfamP40630 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TfamP40630 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TfamP40630 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TfamP40630 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TfamP40630 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TfamP40630 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TfamP40630 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TfamP40630 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TfamP40630 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TfamP40630 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TfamP40630 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TfamP40630 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TfamP40630 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TfamP40630 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TfamP40630 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TfamP40630 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TfamP40630 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TfamP40630 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TfamP40630 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TfamP40630 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TfamP40630 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TfamP40630 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TfamP40630 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TfamP40630 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TfamP40630 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TfamP40630 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TfamP40630 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TfamP40630 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TfamP40630 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TfamP40630 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TfamP40630 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TfamP40630 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TfamP40630 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TfamP40630 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TfamP40630 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TfamP40630 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TfamP40630 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TfamP40630 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TfamP40630 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TfamP40630 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TfamP40630 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TfamP40630 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TfamP40630 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TfamP40630 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms