Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PtprkP35822 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprkP35822 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PtprkP35822 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PtprkP35822 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
PtprkP35822 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprkP35822 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PtprkP35822 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PtprkP35822 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PtprkP35822 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprkP35822 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
PtprkP35822 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PtprkP35822 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PtprkP35822 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprkP35822 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprkP35822 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PtprkP35822 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprkP35822 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PtprkP35822 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprkP35822 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PtprkP35822 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms