Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ly6dP35459 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ly6dP35459 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ly6dP35459 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms