Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxa11P31311 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxa11P31311 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxa11P31311 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms