Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Hoxa10P31310 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hoxa10P31310 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms