Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hoxa2P31245 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxa2P31245 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxa2P31245 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms