Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp1P29452 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Casp1P29452 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Casp1P29452 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp1P29452 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp1P29452 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp1P29452 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Casp1P29452 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Casp1P29452 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp1P29452 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp1P29452 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Casp1P29452 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms