Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxd10P28359 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxd10P28359 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Hoxd10P28359 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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