Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Psmb9P28076 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb9P28076 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Psmb9P28076 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.8 ms