Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tnnc2P20801 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tnnc2P20801 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 261.8 ms