Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a1P19437 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ms4a1P19437 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a1P19437 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms