Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RargP18911 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RargP18911 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RargP18911 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RargP18911 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RargP18911 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RargP18911 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RargP18911 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RargP18911 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RargP18911 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RargP18911 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RargP18911 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RargP18911 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RargP18911 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RargP18911 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RargP18911 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RargP18911 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RargP18911 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RargP18911 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RargP18911 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RargP18911 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RargP18911 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RargP18911 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RargP18911 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RargP18911 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RargP18911 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RargP18911 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RargP18911 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RargP18911 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RargP18911 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RargP18911 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RargP18911 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RargP18911 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RargP18911 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RargP18911 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RargP18911 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RargP18911 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RargP18911 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RargP18911 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RargP18911 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RargP18911 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RargP18911 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RargP18911 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RargP18911 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RargP18911 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RargP18911 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RargP18911 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RargP18911 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RargP18911 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RargP18911 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RargP18911 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RargP18911 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RargP18911 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms