Protein–RNA interactions for Protein: P18242

Ctsd, Cathepsin D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsdP18242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtsdP18242 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CtsdP18242 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsdP18242 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsdP18242 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CtsdP18242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CtsdP18242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms