Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxb1P17919 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxb1P17919 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Hoxb1P17919 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms