Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spi1P17433 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Spi1P17433 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Spi1P17433 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Spi1P17433 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spi1P17433 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Spi1P17433 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms