Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sptan1P16546 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sptan1P16546 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sptan1P16546 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms