Protein–RNA interactions for Protein: P16332

Mut, Methylmalonyl-CoA mutase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MutP16332 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MutP16332 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MutP16332 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MutP16332 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MutP16332 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MutP16332 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MutP16332 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MutP16332 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MutP16332 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MutP16332 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MutP16332 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.33■■□□□ 1
MutP16332 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MutP16332 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MutP16332 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MutP16332 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MutP16332 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MutP16332 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MutP16332 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MutP16332 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MutP16332 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MutP16332 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MutP16332 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MutP16332 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MutP16332 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MutP16332 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MutP16332 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MutP16332 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MutP16332 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MutP16332 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MutP16332 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MutP16332 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MutP16332 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MutP16332 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MutP16332 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MutP16332 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MutP16332 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MutP16332 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MutP16332 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MutP16332 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MutP16332 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MutP16332 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MutP16332 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MutP16332 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MutP16332 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MutP16332 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms