Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vpreb1P13372 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vpreb1P13372 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms