Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
Tnp1P10856 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1
Tnp1P10856 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
Tnp1P10856 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
Tnp1P10856 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Tnp1P10856 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Tnp1P10856 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
Tnp1P10856 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Tnp1P10856 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms