Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Amd1P0DMN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Amd1P0DMN7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Amd1P0DMN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms