Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NeflP08551 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NeflP08551 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NeflP08551 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NeflP08551 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NeflP08551 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NeflP08551 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NeflP08551 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NeflP08551 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NeflP08551 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NeflP08551 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NeflP08551 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NeflP08551 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NeflP08551 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NeflP08551 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NeflP08551 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NeflP08551 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NeflP08551 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
NeflP08551 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NeflP08551 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NeflP08551 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NeflP08551 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NeflP08551 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NeflP08551 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeflP08551 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NeflP08551 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NeflP08551 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NeflP08551 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NeflP08551 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NeflP08551 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeflP08551 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeflP08551 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NeflP08551 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeflP08551 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeflP08551 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeflP08551 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeflP08551 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeflP08551 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeflP08551 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeflP08551 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NeflP08551 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NeflP08551 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NeflP08551 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NeflP08551 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NeflP08551 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NeflP08551 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NeflP08551 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeflP08551 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeflP08551 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeflP08551 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeflP08551 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeflP08551 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NeflP08551 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NeflP08551 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NeflP08551 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NeflP08551 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NeflP08551 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NeflP08551 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NeflP08551 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NeflP08551 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NeflP08551 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NeflP08551 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NeflP08551 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NeflP08551 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NeflP08551 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NeflP08551 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NeflP08551 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NeflP08551 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NeflP08551 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms