Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TtrP07309 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TtrP07309 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TtrP07309 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtrP07309 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtrP07309 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtrP07309 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TtrP07309 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TtrP07309 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtrP07309 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtrP07309 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtrP07309 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtrP07309 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TtrP07309 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TtrP07309 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtrP07309 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtrP07309 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtrP07309 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtrP07309 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TtrP07309 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TtrP07309 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TtrP07309 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtrP07309 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtrP07309 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtrP07309 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtrP07309 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TtrP07309 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TtrP07309 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TtrP07309 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TtrP07309 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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