Protein–RNA interactions for Protein: P02772

Afp, Alpha-fetoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfpP02772 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AfpP02772 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AfpP02772 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AfpP02772 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AfpP02772 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AfpP02772 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AfpP02772 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AfpP02772 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AfpP02772 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AfpP02772 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AfpP02772 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AfpP02772 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AfpP02772 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AfpP02772 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AfpP02772 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AfpP02772 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AfpP02772 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AfpP02772 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AfpP02772 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AfpP02772 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AfpP02772 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AfpP02772 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AfpP02772 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AfpP02772 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AfpP02772 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AfpP02772 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AfpP02772 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AfpP02772 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AfpP02772 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AfpP02772 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AfpP02772 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AfpP02772 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AfpP02772 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AfpP02772 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AfpP02772 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AfpP02772 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AfpP02772 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AfpP02772 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AfpP02772 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AfpP02772 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AfpP02772 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AfpP02772 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AfpP02772 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AfpP02772 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AfpP02772 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AfpP02772 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AfpP02772 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AfpP02772 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms