Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sypl2O89104 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Sypl2O89104 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sypl2O89104 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms