Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tcn2O88968 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tcn2O88968 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tcn2O88968 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms