Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Shoc2O88520 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Shoc2O88520 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Shoc2O88520 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Shoc2O88520 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms