Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lnx1O70263 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lnx1O70263 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lnx1O70263 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms