Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SlkO54988 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SlkO54988 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SlkO54988 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SlkO54988 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SlkO54988 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SlkO54988 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SlkO54988 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SlkO54988 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SlkO54988 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SlkO54988 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SlkO54988 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SlkO54988 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SlkO54988 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SlkO54988 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SlkO54988 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms