Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cavin1O54724 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cavin1O54724 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cavin1O54724 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cavin1O54724 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms