Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Bnc1O35914 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bnc1O35914 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bnc1O35914 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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