Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nedd9O35177 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd9O35177 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nedd9O35177 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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