Protein–RNA interactions for Protein: M0QW81

Gm3488, Predicted gene, 3488, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3488M0QW81 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm3488M0QW81 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm3488M0QW81 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm3488M0QW81 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.9 ms