Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
IfnabL7MTU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IfnabL7MTU6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IfnabL7MTU6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms