Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm2056J3QQ02 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm2056J3QQ02 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gm2056J3QQ02 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms