Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mfsd4b4J3QNS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mfsd4b4J3QNS5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mfsd4b4J3QNS5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms