Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Smim18J3QNP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Smim18J3QNP2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Smim18J3QNP2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms